为了解我国结核病耐药性的流行现状，分析耐药产生的影响因素，并为动态监测结核病耐药变化趋势提供基线资料。2006年10月，卫生部下发“关于开展全国结核病耐药基线调查的通知”(卫疾控发【2006】246号)，决定在全国开展结核病耐药基线调查。本次调查工作由卫生部领导，办公室设在我所中国疾病控制结核病防治临床中心。

　　本次开展的全国首次结核病耐药基线调查，覆盖全国31个省市及自治区，抽取70个区县作为调查点，覆盖人口4700万人。为保证调查结果的准确性，我院临床中心先后组织世界卫生组织、中国疾病控制中心、卫生部结核病专家咨询委员会等结核病领域以及卫生统计、流行病学知名专家多次研讨、论证，初步确定了基线调查的抽样方案、病例纳入、药敏试验及质量控制等关键内容，举办了6次“全国结核病耐药性基线调查”培训班，探讨了在全国开展结核病耐药性调查的科学性、可行性。2007年4月，全国统一启动结核病耐药性基线调查。共筛查30000例可疑肺结核患者，各调查点纳入的肺结核患者总病例数4600例，完成率为96.6%。至2009年初药敏试验工作全部结束，完成了《全国结核病耐药性基线调查报告》。

　　本次耐药基线调查，是卫生部组织的我国第一次全国性的、专门针对结核病耐药疫情开展的基线调查，其设计科学、组织有序、数据可靠、分析全面，为我国耐药结核病防治策略和措施的制定提供了科学依据，具有重要的指导意义。