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侯代伦2014年获得山东省医学科技奖励委员会“山东省医学科技奖”三等奖，2017年被评为中华医学会结核病学分会杰出青年人才，2019年12月入选通州区高层次人才发展支持计划领军人才，2020年《CT 不同切面小关节面变化与腰椎结核椎体滑脱相关性及治疗价值探讨》获得中国防痨协会“科学技术奖”二等奖。
