【科研论文】胸腔积液cfDNA+cfRNA：准确、快速地检测驱动基因的突变和融合

　　2021年4月，由首都医科大学附属北京胸科医院病理科车南颖教授团队，在Cancer Medicine 杂志上发表了《胸腔积液上清提取cfDNA和cfRNA，PCR法可以准确、快速地检测晚期NSCLC患者驱动基因的突变和融合》（Multigene PCR using both cfDNA and cfRNA in the supernatant of pleural effusion achieves accurate and rapid detection of mutations and fusion of driver genes in patients with advanced NSCLC）。该研究提出：胸腔积液标本的上清液可以实现基于cfDNA的变异检测和基于cfRNA的融合变异检测，建议对于无法获取足够组织标本的晚期NSCLC患者，胸腔积液上清是检测肺癌驱动基因变异的首选标本。

　　接受靶向治疗或免疫治疗之前，对肿瘤进行驱动基因检测已经纳入国内外专家共识和临床指南之中。其中，肿瘤组织标本的基因变异谱分析是临床实践中的“金标准”。然而，并不是所有患者均能获取足够组织标本，因此，包括血浆、胸腔积液、脑脊液、尿液和痰在内的液体活检样品已成为分子检测有希望的替代样本类型。其中，外周血cfDNA被认为是液体活检的主要标本类型，已被用作检测NSCLC驱动基因改变的补充或替代样本，但它在检测驱动基因特别是融合基因方面，存在灵敏度低的缺点。因此，同时检测包括突变和融合在内的多基因改变已成为常规的临床需要。

　　恶性胸水是非小细胞肺癌常见的并发症之一，约有15%的患者在初诊时出现胸水症状，而在疾病发展进程中有接近50%的患者会出现胸水的症状。多项研究报道，来源于胸腔积液的cfDNA可用于检测驱动基因改变，并作为肿瘤组织的等效标本。然而，将胸腔积液上清液与细胞沉积物、细胞块进行多基因改变检测，特别是对cfRNA进行融合检测，尚未得到充分研究。因此，该研究通过连续性纳入合并胸腔积液的疑似非小细胞肺癌患者，评估了胸腔积液上清、细胞沉积物和细胞块三种样品标本进行驱动基因突变检测的有效性和准确性。

　　统计学结果显示：以肿瘤组织中的驱动基因突变作为参考，上清液、细胞沉积物和细胞块均显示出100% 的特异性。胸腔积液上清的总体灵敏度81.3%，高于细胞块71.0%，高于细胞沉积物66.7%。本研究结果还显示：用PCR方法在恶性胸腔积液上清液中提取cfRNA，并成功检测到融合基因，与配对组织样本的一致性高达97.9%，这进一步证实了胸腔积液标本在检测融合变异方面优于血浆标本。鉴于胸腔积液上清在多基因联检中的优越表现，建议把胸腔积液上清作为对晚期非小细胞肺癌患者检测基因改变的首选标本。

　　参考文献：Xuejing Chen, Kun Li, Zichen Liu, Fei Gai, Guanshan Zhu, Shun Lu, Nanying Che. Multigene PCR using both cfDNA and cfRNA in the supernatant of pleural effusion achieves accurate and rapid detection of mutations and fusions of driver genes in patients with advanced NSCLC. Cancer Med. 2021, 10(7):2286-2292.