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Nature genetics:耐药结核杆菌的演化
从农业开端到苏联解体,人类历史上的重大事件都在能够导致肺结核(TB)的细菌的脱氧核糖核酸(DNA)中留下了印记。对全世界近5000个结核分枝杆菌样本进行的一项新研究,揭示了数千年前在亚洲出现的一种细菌最终如何成为了一个全球杀手,乃至对抗菌药物产生了广泛的耐药性。
起源与发展
尽管结核分枝杆菌的第一次出现可能是在4万年前的非洲,但这种传染病并没有在人群中“生根发芽”,直到人类走向农业社会,并随之定居下来。之前的一项分析表明,所有今天流行的结核分枝杆菌的共同祖先大约于1万年前在古代肥沃月湾地区开始传播。
然而在当前流行的所有结核分枝杆菌中,没有一个比北京系(Beijing lineage)结核分枝杆菌更让公共卫生官员感到头疼了。北京系结核分枝杆菌最早出现于中国东北地区,时间大约在距今6600年前。最早于20世纪90年代中期在大北京地区鉴定,这种细菌不仅已经扩散到了全世界,而且对能够治疗其他类型肺结核的多种抗生素产生了耐药性。
全球传播
Wirth研究团队从99个国家采集并分析了4987个北京系结核分枝杆菌样本,对其中的110个样本进行了全基因组测序。研究人员随后利用这些信息回溯了北京系结核分枝杆菌的演化历史及相关情况。
连接中国与中东地区的“丝绸之路”: 有助于这种结核分枝杆菌走出东亚地区向外传播
人口迁徙引起菌株散播到太平洋岛屿和中亚地区:在太平洋传播的一类菌株可能是1850年间向太平洋岛屿移民的中国居民所携带的;而在中亚地区的前苏联的分支可能是在19世纪60年代至70年代之间,由于吉尔吉斯斯坦,哈萨克斯坦和乌兹别克斯坦发生国家起义,中国移民进行转移和疏散所带来的。
全球巨变也为北京系结核分枝杆菌的兴起推波助澜:19世纪早期菌种数量的快速增长可能是因为工业革命期间城市人口数量激增所导致的。而20世纪早期数量的再次飙升,则与第一次世界大战后,进一步的城市化和流感大流行相关。
艾滋病毒的传播以及苏联解体:在20世纪60年代出现了一个喘息的机会,因为新类型抗生素的使用,结核病发生率开始下降。然而在80年和90年代初,该菌株又卷土重来。Wirth团队指出这种现象的发生与当时艾滋病毒的增加以及苏联解体有关,苏联卫生系统的崩溃被广泛认为是导致肺结核激增及其多重耐药性形成的一大因素。
Wirth指出,自从北京系结核分枝杆菌出现以来,这种细菌的传染性变得越来越强,并超越了其他所有的肺结核致病菌。他的研究团队已经鉴定了使得北京系结核分枝杆菌变得如此“成功”的与抗生素耐药性、新陈代谢和逃避免疫应答有关的突变。
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